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甘肃省渔业技术推广总站成立于1987年，2004年省农牧厅直属事业单位机构改革中，将甘肃省渔业技术推广总站与刘家峡水库渔场、 甘肃省河西水产良种试验场合并，组建甘肃省渔业技术推广总站，加挂甘肃省刘家峡水库渔政管理站、甘肃省水生动物防疫检疫中心的牌子，2008年9月又加挂甘肃刘家峡水产种质资源管理局，县级建制，核定事业编制120名，其中：财政拨款45名，自收自支75名，县级领导职数5名。单位内设机构有：办公室、人事科、财务科、业务科、病害防治科（加挂水生动物防疫检疫办公室的牌子）、刘家峡基地管理科、渔政科（加挂保卫科的牌子）、生产经营科、河西水产良种试验站（加挂祁连雪冷水鱼良种繁育中心的牌子）、白银鱼类良种试验站、黄河鲤鱼原种场（加挂水产引育种中心的牌子）
